［文献解读］液体活检技术用于检测膀胱癌患者基因组改变

Genomic Alterations in Liquid Biopsies from Patients with Bladder Cancer
european urology IF: 14.976

背景
1．膀胱癌（Bladder cancer, BCa）是泌尿系统最常见的恶性肿瘤，也是全身十大常见肿瘤之一，占我国泌尿生殖系肿瘤发病率的第一位。膀胱癌复发率较高，术后5年复发率接近50%；
2.目前对膀胱癌术后复发的预测手段非常有限，临床常用的预后指标也缺乏灵敏性与特异性；
3.检测外周血与尿液中的游离肿瘤细胞DNA是理想的膀胱癌复发监测指标
摘要
该研究为回顾性研究，1994-2015年间收集12名初诊为非肌肉浸润型膀胱癌患者，对该12名患者术后不同时间节点血浆样本和尿液样本中游离肿瘤细胞DNA进行体细胞变异检测，以监控肿瘤患者的复发及病情进展。相比传统影像学检测，血浆样本和尿液样本中肿瘤DNA检测能够更早的监测到肿瘤患者复发与病情进展。
研究思路

1. 患者癌组织进行DNA测序以鉴定个体肿瘤遗传特征。
2. 根据DNA测序结果制订个性化检测方案。
3. 对患者术后不同时间节点血浆样本和尿液样本中游离肿瘤细胞DNA进行体细胞变异检测，以监控肿瘤患者的复发及病情进展。
患者分组
12名患者包括9名男性和3名女性，初诊平均年龄69岁（44-85岁），根据患者术后病情进展情况分为2组，分别为PRO组和REC组。PRO组膀胱癌患者不仅发生复发，且病情进展/转移；REC组患者仅发生原位复发。
个性化检测突变位点
根据癌组织DNA高通量测序结果制订12名患者个性化体细胞变异检测，每名患者平均检测体细胞变异个数为3.8个（1个-6个）。所检体细胞变异类型包括染色体插入（Insertion）、染色体缺失（Deletion）、 染色体倒位（inversion）。
不同类型样本cell-free tumour DNA 浓度比较


1.比较血浆样本中cfDNA、ctDNA浓度，PRO组患者和REC组患者间无显著差异；
2.尿液样本ucfDNA、Tumor ucfDNA浓度PRO组患者明显高于REC组患者，差异显著。
PRO组各节点血浆与尿液肿瘤细胞DNA检出比较

5名患者血浆样本中可检出tumour DNA，而尿液样本中tumour DNA的检出率为100%；
67%（4/6）PRO组患者血浆中tumour DNA检出早于临床进展 ，全部6名患者尿液样本中tumour DNA检出均早于临床进展；
相同节点，尿液样本tumour DNA检出量普遍高于血浆样本检出量（1名患者例外）。
REC组各节点血浆与尿液肿瘤细胞DNA检出比较

1名患者血浆样本中未检出tumour DNA，4名患者术后血浆样本tumour DNA检出量较低（<60 copys/ml）；
患者pt03，尿液样本tumour DNA检出量普遍高于血浆样本检出量。其余患者两种样本tumour DNA检出量并无显著差异。
结论
12名膀胱癌患者尿液样本中均可检出cell-free tumour DNA，而10名患者血浆样本cell-free tumour DNA检出阳性；
REC组患者仅出现原位复发，无病情进展/转移，与出现病情进展/转移的PRO组患者相比，血浆样本和尿液样本样本中肿瘤细胞DNA量均普遍低。两种类型样本肿瘤细胞DNA检出量与肿瘤患者病情进展正相关；
监测两种类型样本中的cell-free tumour DNA均可用于膀胱癌预后、复发监测。
转自吉因加科技微信订阅号