本帖最后由 漓江渔翁 于 2015-8-30 10:06 编辑
IC50和几种靶向药的IC50值(资料整理)
一 ic50是指被抑制一半时抑制剂的浓度,这里的反应可以是酶催化反应,抗原抗体反应等。在凋亡方面,可以理解为一定浓度的某种药物诱导肿瘤细胞凋亡50%,该浓度称为50%抑制浓度,即凋亡细胞与全部细胞数之比等于50%时所对应的浓度,IC50值可以用来衡量药物诱导凋亡的能力,诱导能力越强,该数值越低,当然也可以反向说明某种细胞对药物的耐受程度。
1基本介绍
简介
英文全称halfmaximal(50%)inhibitoryconcentration(IC)ofasubstance(50%IC,orIC50).
计算方法
IC50和EC50的计算一般需要测定5个以上的点,再通过曲线拟合得到函数计算而得,或者假设IC50(EC50)附近的点连成直线计算而得等,但这都存在较大的误差。因为拟合的函数曲线并不能保证都通过所测定的点,其次IC50(EC50)附近的点并不都连成直线,所以计算误差较大。IC50(EC50)计算软件解决了以上问题。本软件输入可以为多组试验数据,软件将自动取最靠近IC50(EC50)处的三个点进行二次曲线拟合,所建立的函数能完全通过IC50(EC50)附近的3个点,决定系数R2=1.00,并自动生成曲线图、曲线方程和IC50(EC50)值。支持曲线图的复制、粘贴及图上上文字的编辑。在保证试验数据精度的前提下可以确保在IC50(EC50)周围的曲线的高精度,由此算得的IC50(EC50)可以保证是高精度的,使用效果很好。
2英文定义
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IC50, the half maximal inhibitory concentration, represents the concentration of an inhibitor that is required for 50% inhibition of things like an enzyme, a cell, a cell receptor or a microorganism.
It's commonly used as a measure of drug effectiveness. Another measure of drug efficacy is EC50 which represents the concentration of a compound that is required to obtain 50% of the maximum effect. (Ex. EC100 would be the minimum concentration of a compound to obtain 100% of its effect).
3半抑制率
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半抑制浓度(或称半抑制率),即IC50。在间接竞争ELISA标准曲线中是一个非常重要的数据,标准曲线是一个S型曲线。
ICELISA中,不添加抑制物质的对照孔的OD值为B0,添加了抑制物质的孔的OD值为B
B/B0%就叫做结合率,在结合率为50%时所对应的抑制物质的浓度就叫做IC50。
一般IC50的数值越小,说明你的抗体的特异性能越强!
最小检测限为试剂盒标准曲线的最小的浓度,小于最小浓度或大于最大浓度,即不在曲线范围内的都不准确,大于最大浓度可以稀释后测。
IC50为50%抑制浓度即B/B0=50%时所对应的浓度,半数抑制是用来衡量抗体灵敏度的半数抑制越低,说明抗体的灵敏度越高。
通常来说,试剂盒最大和最小量程应该是该抗体用来检测标准品的检测限,检测限分最大和最小检测限。
检测下限一般为理论值,是根据标准曲线算出来的理论上可以检测到的最小的值;
定量限为实际检测时可以定量的最低的值;
而最大检测限就是实际操作中抑制率达到100%时的药物浓度。
检测下限(LOD)对应的OD值:OD(LOD)=B0-3SD
定量限(LOQ)对应的OD值:OD(LOQ)=B0-10SD
4浓度
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如果只是IC50,一个底物浓度就够了。但是IC50会随底物浓度的变化而变化,所以你要指定一个底物的浓度,发表IC50的时候要注明你底物的浓度。这个浓度如果没有任何依据的随意指定一个,感觉上就会不专业。如果你已经有其它人关于这个酶和其它抑制剂的资料(并且上面详细注明了所用的酶和底物的浓度,还有对底物的Km),你当然可以省事的在其它人的底物浓度下测你的IC50。不过如果你没有详细的相关资料或者不很肯定查到的相关数据,最好是先自己做一下这个酶的动力学曲线。具体怎么做动力学找本书上就有了。简单的就是根据相关资料(新的酶就要看自己的感觉了)设计几个底物浓度,然后调整加的酶的浓度使得所有速度曲线在引发后的几分钟都是线性的,而且前几分钟消耗的底物量一定不要超过底物总浓度的10%。底物的浓度你要高高低低地试几次,然后估算出Km的大致值(加许多底物让酶饱和,这个时候测出的速度应该是Vmax,Km就是使得速度为Vmax一半的时候的底物浓度)。然后你设计10~15个底物浓度点上及5倍Km,下及1/5Km,注意Km附近点要密集些因为正是曲线的拐弯处。情况好的话你就会拿到那个酶的Michaelis-Menten曲线(X轴底物浓度Y轴速度),处理后得到Km和Kcat。我觉得最后指定的测IC50的底物浓度要么是Km,要么是3xKm或5xKm(饱和)。
5原理
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噻唑兰,简称MTT,可透过细胞膜进入细胞内,活细胞线粒体中的琥珀脱氢酶能使外源性MTT还原为难溶于水的蓝紫色的甲臜(Formazan)结晶并沉积在细胞中,结晶物能被二甲基亚砜(DMSO)溶解,用酶联免疫检测仪在490nm波长处测定其光吸收值,可间接反映细胞数量。
二 几种靶向药的IC50值
易瑞沙:Gefitinib (ZD1839) Gefitinib (ZD1839)是一种EGFR抑制剂,作用于NR6wtEGFR和NR6W细胞中的Tyr1173,Tyr992,Tyr1173和Tyr992,IC50 分别为37 nM,37nM,26 nM和57 nM。
特罗凯:Erlotinib HCl (OSI-744)是一种EGFR抑制剂,在无细胞试验中IC50为2 nM,对EGFR的选择性比对人c-Src或v-Abl高1000多倍。
凯美钠:Icotinib是一种有效的,特异性EGFR抑制剂,IC50为5 nM,包括EGFR, EGFR(L858R), EGFR(L861Q), EGFR(T790M)和EGFR(T790M, L858R)。Phase 4。
阿法替尼:Afatinib (BIBW2992) Dimaleate 不可逆地抑制 EGFR/HER2,包括 EGFR(wt),EGFR(L858R),EGFR(L858R/T790M) 和 HER2,IC50 分别为0.5 nM,0.4 nM,10 nM 和 14 nM;活性比对Gefitinib抵抗型L858R-T790M EGFR突变体高100倍。
299804:Dacomitinib (PF299804, PF299)是一种有效的,不可逆的泛ErbB抑制剂,最有效作用于EGFR,无细胞试验中IC50为6 nM,高效作用于携带EGFR或ERBB2突变型(耐Gefitinib)和携带EGFR T790M突变型的NSCLCs。Phase 2。
Poziotinib/HM781-36B:Poziotinib (HM781-36B)是一种不可逆的泛-HER抑制剂,对HER1,HER2,和HER4的IC50分别为3.2 nM,5.3 nM和23.5 nM。
WZ4002:WZ4002是一种新型的,突变选择性EGFR抑制剂,作用于EGFR(L858R)/(T790M),在BaF3细胞系中IC50为2 nM/8 nM;对ERBB2磷酸化(T798I)没有抑制作用。
AZD9291:是口服不可逆的,突变选择性EGFR抑制剂,在 LoVo细胞中对Exon 19 缺失的 EGFR,L858R/T790M EGFR,和 WT EGFR的IC50分别为12.92,11.44 和 493.8 nM。Phase 3。
Rociletinib/CO-1686: Rociletinib (CO-1686, AVL-301)是一种不可逆的,突变选择性EGFR抑制剂,在无细胞试验中作用于EGFRL858R/T790M和EGFRWT, Ki分别为21.5 nM和303.3 nM。Phase 2。
Vandetanib/凡德他尼: Vandetanib (ZD6474)是一种有效的VEGFR2抑制剂,在无细胞试验中IC50为40 nM。
Axitinib/阿西替尼: Axitinib是一种多靶点抑制剂,作用于 VEGFR1,VEGFR2,VEGFR3,PDGFRβ和c-Kit,在猪主动脉内皮细胞中IC50分别为0.1 nM,0.2 nM,0.1-0.3 nM,1.6 nM和1.7 nM。
Sorafenib/索拉非尼/多吉美/Nexavar: Sorafenib Tosylate是一种酪氨酸激酶(VEGFR和PDGFR)和RAF/MEK/ERK级联抑制剂,同时作用于Raf-1,wtBRAF和V599EBRAF,IC50分别为6 nM, 22 nM和38 nM。Sorafenib Tosylate is a multikinase inhibitor of Raf-1, B-Raf and VEGFR-2 with IC50 of 6 nM, 22 nM and
Sunitinib/舒尼替尼/索坦/Sutent: Sunitinib 是一种多靶点 RTK 抑制剂,以VEGFR2(Flk-1)和PDGFRβ为靶点,IC50为80 nM 和 2 nM,对c-Kit也有抑制作用。
Cabozantinib/XL184/Cometriq/卡博替尼: Cabozantinib (XL184, BMS-907351)是一种有效的VEGFR2抑制剂,在无细胞试验中IC50为0.035 nM,也能有效抑制c-Met、 Ret、 Kit、Flt-1/3/4、Tie2和AXL,IC50分别为1.3 nM,4 nM,4.6 nM,12 nM/11.3 nM/6 nM,14.3 nM 和 7 nM。
Tivozanib/TIVO-1:ivozanib (AV-951)是一种有效的,选择性VEGFR抑制剂,作用于VEGFR1/2/3时,IC50分别为0.21 nM/0.16 nM/0.24 nM,也抑制PDGFR和c-Kit,作用于FGFR-1, Flt3, c-Met EGFR和IGF-1R活性较弱。Phase 3。
Buparlisib/BKM120:KM120 (NVP-BKM120, Buparlisib) 是一种选择性 PI3K 抑制剂,在无细胞试验中作用于p110α/β/δ/γ的IC50分别为 52 nM/166 nM/116 nM/262 nM。对 VPS34,mTOR,DNAPK 的作用效果下降,而对 PI4Kβ几乎没有活性。Phase 2。
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